Het Cosmicus Montessori Lyceum doet mee aan de Nederlandse Wiskunde Olympiade (NWO) en de Nationale Biologie Olympiade (NBO). Dit zijn wedstrijden voor leerlingen van het middelbaar onderwijs die talent hebben voor wiskunde of biologie. Na een aantal ronden waarin getoetst wordt op kennis, inzicht en vaardigheden zullen de winnaars naar de Internationale Olympiades gaan om daar Nederland te vertegenwoordigen. Voordat de finalisten van de eindronde naar de Internationale Olympiade gaan vindt er een huldiging op het ministerie van OCW plaats. Alle Nationale Olympiades nemen aan deze plechtigheid deel en de huldiging wordt voltrokken door de minister of staatssecretaris.

De Junior Olympiade is voor havo/vwoleerlingen van klas 1, 2 en 3. Ieder jaar doen meer dan 100 scholen mee. In 2007 ging het om bijna 5000 leerlingen en dit aantal wordt ieder jaar groter. De voorronde is 3 t/m 14 maart 2009 en wordt gewoon op school gemaakt. Je maakt een toets van ongeveer 1 lesuur en die wordt nagekeken door je docent. De 20 beste leerlingen doen dan eind mei mee met de eindronde.

De eindronde duurt 3 dagen en wordt gehouden op de Universiteit Leiden. Tijdens deze drie dagen krijg je o.a. colleges en een practicum over interessante biologie-onderwerpen. Er is ook een excursie naar het nationaal Natuurhistorisch Museum: Naturalis. 's Avonds is er tijd om een beetje te studeren, want de volgende dag wordt de kennis getoetst. De vragen die dan gesteld worden zijn vooral inzichtvragen. Aan het einde van de week is er voor de winnaars een prijs en een medaille.